Pesquisadores mapeiam toda a população de microrganismos da cana-de-açúcar, Fapesp

12 de julho de 2016

Diego Freire  |  Agência FAPESP – Um único exemplar de cana-de-açúcar é lar de 23.811 tipos de bactérias e 11.727 grupos diferentes de fungos. O achado é de pesquisadores do Instituto de Biologia (IB) da Universidade Estadual de Campinas (Unicamp), que realizaram o mapeamento completo e inédito das comunidades de microrganismos que habitam todos os tecidos da cana, da raiz às folhas.

A pesquisa, realizada no Laboratório Central de Tecnologias de Alto Desempenho em Ciências da Vida (LaCTAD), que conta com o apoio da FAPESP na modalidade Equipamentos Multiusuários(EMU), teve dois artigos publicados na revista Scientific Reports, do grupo Nature; o primeiro no dia 30 de junho, relatando o mapeamento completo do microbioma, o conjunto de microrganismos que vivem nos diferentes órgãos da planta; o segundo, publicado na terça-feira (12/07), apresenta um novo método para o isolamento e o cultivo de coleções dessas populações para o estudo das funções que elas desempenham para a planta.

Isso porque a microbiota dos vegetais, como a dos animais, medeia interações importantes entre o organismo e o seu meio – entre as quais, nas plantas, está a conversão do nitrogênio atmosférico em compostos nitrogenados, utilizados na síntese de proteínas. Mas, de acordo com os pesquisadores, sem o mapeamento completo do microbioma não seria possível conhecer mais a fundo essa relação, cuja compreensão pode fazer avançar a biotecnologia voltada para a produção agrícola sustentável.

“Existe uma comunidade de microrganismos habitando todos os organismos superiores que é fundamental para o favorecimento do sistema imune nos animais, no homem e nas plantas, atuando inclusive na defesa contra patógenos. No entanto, é de conhecimento da comunidade científica pouco mais do que meia dúzia de funções desempenhadas pelas bactérias e fungos dos vegetais, e estudos que avaliam a diversidade, a estrutura e o impacto dessa microbiota em culturas de importância econômica ainda são raros. Esses dois papers trazem uma nova visão do microbioma da cana e de como acessá-lo para desenvolver tecnologias baseadas na associação entre plantas e microrganismos”, disse Paulo Arruda, professor do Departamento de Genética e Evolução do IB-Unicamp. 

Os pesquisadores realizaram um inventário completo da estrutura e da composição das comunidades bacterianas e fúngicas associadas à cana. As mais de 35 mil espécies de bactérias e fungos mapeadas habitam o interior e a superfície de raízes, brotos e folhas.

“Esses milhares de tipos de microrganismos não devem estar contribuindo apenas para a meia dúzia de funções da microbiota da planta que são conhecidas atualmente. Trata-se de uma caixa-preta da biologia a ser desbravada”, disse Arruda, que também coordena o Centro de Biologia Química de Proteínas (SGC-Unicamp), apoiado pela FAPESP por meio do Programa Parceria para Inovação Tecnológica (PITE).

Mapa dos microrganismos

A identificação massiva das espécies de microrganismos que habitam a cana foi possível graças ao uso de um sequenciador de segunda geração, cuja tecnologia permite sequenciar marcadores de DNA microbiômico presentes em amostras de raiz, brotos e folhas sem a necessidade de se isolar e cultivar cada espécie de bactéria e fungo em laboratório, como era feito até então.

“Até pouco tempo atrás, por conta das limitações tecnológicas, a pesquisa ficava refém do cultivo de bactérias em laboratório, o que é um trabalho moroso e que resulta numa quantidade muito pequena de amostras, especialmente porque muitas espécies não crescem em meios de cultura. Dessa forma, conhecia-se apenas superficialmente a real diversidade das comunidades de microrganismos que habitam cada tecido da planta”, disse Rafael Soares Correa de Souza, do Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG) da Unicamp.

Além disso, ainda de acordo com o pesquisador, “a maioria dos trabalhos na área estava focada em analisar o microbioma apenas da raiz, determinando quais são as bactérias e demais microrganismos que se associam a ela e que estariam relacionados à apreensão de nutrientes e outros processos”.

O trabalho desenvolvido com o sequenciamento de segunda geração mapeou o microbioma da cana contemplando comunidades que vivem fora e dentro da raiz, do caule e nas folhas em diferentes estágios de desenvolvimento. Os pesquisadores agora dispõem de um “mapa” completo para saber quais são as bactérias e fungos mais abundantes, suas funções e possíveis aplicações biotecnológicas, acessando toda uma diversidade que não podia ser desbravada até então.

Para isso, foi desenvolvido um protocolo próprio de preparo do sequenciamento. Os pesquisadores coletaram amostras da raiz, do caule e das folhas separadamente e lavaram cada uma com uma solução especial. A água residual foi submetida a centrifugação de baixa velocidade para que resíduos do solo e do ambiente fossem separados, isolando-se os microrganismos. Em seguida, uma nova centrifugação foi feita – dessa vez, em alta velocidade – para precipitar as células contendo o material genético que seria sequenciado. O mesmo processo foi feito para os microrganismos que habitam o interior da planta, sendo que, para expô-los, os tecidos foram triturados no liquidificador.

Além do mapa, os pesquisadores dispõem de coleções de amostras representativas dos microrganismos que vivem no microbioma da planta.

“Essas coleções estão armazenadas de forma a serem facilmente acessadas, o que possibilitará a seleção de microrganismos para compor inóculos que representam diferentes comunidades e que podem ser estudados para que se saiba quais efeitos benéficos eles trazem às plantas. Temos, agora, um mapa e o recurso biológico necessário para o avanço da pesquisa”, disse Jaderson Silveira Leite Armanhi, também do CBMEG.

Além da FAPESP, a pesquisa foi financiada pela companhia energética de origem espanhola Repsol e pela Repsol Sinopec Brasil. Os trabalhos também contaram com a participação de pesquisadores do Centro de Biotecnología y Genómica de Plantas da Universidad Politécnica de Madrid (UPM), na Espanha.

Os resultados do mapeamento são apresentados no artigo Unlocking the bacterial and fungal communities assemblages of sugarcane microbiome, de Rafael Soares Correa de Souza, Vagner Katsumi Okura, Jaderson Silveira Leite Armanhi, Beatriz Jorrín, Núria Lozano, Márcio José da Silva, Manuel González-Guerrero, Laura Migliorini de Araújo, Natália Cristina Verza, Homayoun Chaichian Bagheri, Juan Imperial e Paulo Arruda, disponível para acesso em www.nature.com/articles/srep28774.

Já o artigo Multiplex amplicon sequencing for microbe identification in community-based culture collections, de Jaderson Silveira Leite Armanhi, Rafael Soares Correa de Souza, Laura Migliorini de Araújo, Vagner Katsumi Okura, Piotr Mieczkowski, Juan Imperial e Paulo Arruda, divulgado hoje, pode ser acessado em www.nature.com/articles/srep29543.

VOLTAR

MAIS LIDAS DO MÊS

A revolução oculta de 32, Aliás, OESP

Derrotado nas armas, São Paulo venceu nas iniciativas que modernizaram a economia e a sociedade brasileiras, diz sociólogo

·         3

·          

·          

·          

José de Souza Martins,
O Estado de S.Paulo

09 Julho 2016 | 16h00

Foto: FOTO REPRODUCAO

A Revolução paulista de 9 de julho de 1932 enfrentou não apenas uma ditadura em formação, mas também um preconceito consolidado contra São Paulo. Desde a proclamação da República por Deodoro contra os republicanos civis, mais do que contra a monarquia, era o republicanismo de propensão ditatorial, perfilhado pelo Exército, divergente do republicanismo paulista. E desde a greve geral de 1917, era São Paulo suspeito de ser um Estado de grevistas e bolcheviques. Sobretudo porque era o Estado que mais recebia trabalhadores imigrantes.

Essas concepções apareceram em documentos e em mensagens escritas a carvão nas paredes das casas invadidas nos bairros operários de São Paulo, já na Revolução Tenentista de 1924, que não foi uma revolução paulista, escritas por soldados do Exército, da Marinha e das forças públicas, oriundos de outros Estados, que ocuparam a cidade, bombardeando-a e matando civis inocentes, além de militares em combate. Mais de 500 mortos e muitos feridos e mutilados, crianças, velhos, mulheres, famílias inteiras, nos bairros operários como o Brás, o Belenzinho, a Mooca, o Cambuci. Fábricas foram destruídas, empregos cessaram. Fazia parte das tropas do general Potiguara, que atacou o bairro da Mooca, um desses soldados que mais tarde se juntaria ao bando de Lampião, com o apelido de Jararaca, e morreria no ataque dos cangaceiros a Mossoró, no Rio Grande do Norte. Acabou sendo objeto de devoção, lá mesmo, com fama de santidade. Um retrato daquele Brasil que diferia do Brasil de que São Paulo fazia parte, o das regiões que se modernizavam.

As revoluções tenentistas dos anos 1920 culminariam na Revolução de Outubro de 1930, iniciada no Rio Grande do Sul e liderada por Vargas, com apoio do Partido Democrático de São Paulo. Ainda que minimizado e colocado sob intervenção federal, como se fosse uma colônia, São Paulo deu à composição do Governo Provisório de Vargas o banqueiro e comerciante de café José Maria Whitaker para revigorar a economia e enfrentar criativamente as graves decorrências da crise econômica de 1929, que alcançava o Brasil inteiro. Whitaker antecipou-se a John Maynard Keynes, o formulador da Teoria Geral do Emprego, publicada em 1936, ao adotar em 1930-1931 uma solução pré-keynesiana para a crise, na compra do café colhido, ainda que sem mercado, e na queima dos estoques para manter o fluxo de renda e o nível de emprego na economia cafeeira com seus extensos efeitos multiplicadores na economia do País.

É o que em grande parte explica o surto industrial paulista dos anos 1930 com a manutenção e ampliação de um mercado interno que já não podia ser abastecido por importações devido à insuficiência de divisas. Diferente do que supôs Celso Furtado, o relatório de Whitaker, que ele não leu, indica que o ministro tinha clareza quanto à inovação que estava fazendo. Sua política não foi acaso, que para proteger o café teria promovido a industrialização sem o pretender, como Furtado sugeriu. São Paulo já dispunha de uma base industrial consolidada. Nasceu aí a oculta revolução econômica e social que modificou o Brasil para sempre, libertando-o do domínio da economia colonial de exportação e interiorizando os centros de decisão econômica.

Nos dias que precederam a Revolução de 1932, o Exército redefinia as divisas de São Paulo com Minas Gerais e anexava terras paulistas ao território mineiro, enquanto o governo federal tardava em convocar a Constituinte que os paulistas queriam. Havia, portanto, uma tensão grande em São Paulo quando, num domingo de maio, o promotor público Ibrahim Nobre fez vibrante discurso na Praça do Patriarca, agarrado a um poste de iluminação, clamando por uma constituição e por democracia. A multidão acabaria saindo em marcha pelas ruas da cidade até a Praça da República, na esquina da Rua Barão de Itapetininga. Ali ficava a sede da Legião Revolucionária, que apoiava Vargas. De dentro do prédio, tiros foram disparados, várias pessoas tombaram feridas, quatro mortos, que se tornariam o símbolo da revolta. A Revolução se tornara inevitável.

Derrotado nas armas, São Paulo venceu nas iniciativas decorrentes que consolidaram o nosso caminho de modernização econômica e social. Uma de suas principais iniciativas de vencido que não se dobra foi a da criação da Universidade de São Paulo, uma fábrica de conhecimento, para ela trazendo cientistas e intelectuais dos países desenvolvidos para criar aqui uma universidade de primeiro mundo. Eram os vencidos a quem Vargas ouvia para revolucionar a economia e as relações de trabalho, como Roberto Símonsen, industrial, engenheiro formado pela Escola Politécnica, que apoiara a Revolução de 1932. Era ele o teórico do primado da indústria para vencer a pobreza colonial dos ciclos econômicos que fragilizavam o País. O que possibilitou que milhares de brasileiros do interior e dos Estados vencedores migrassem para São Paulo atraídos pelos empregos que o surto industrial do Estado vencido criava.

JOSÉ DE SOUZA MARTINS É SOCIÓLOGO, MEMBRO DA ACADEMIA PAULISTA DE LETRAS. ENTRE OUTROS

LIVROS, AUTOR DE O CATIVEIRO DA TERRA (CONTEXTO)

Meu caro Waldemiro: carta a um atleta olímpico esquecido, OESP

Uma carta contando em que pé está a Olimpíada a Waldemiro Pinto, o ‘Galo Negro’, atleta olímpico brasileiro que lutou boxe nos Jogos de Roma-1960, provou da glória enquanto esteve na ativa, mas depois foi esquecido, viveu nas ruas de Quito e do Rio de Janeiro e acabou sozinho num asilo até morrer

·         5

·          

·          

·          

Roberto Salim,
O Estado de S.Paulo

09 Julho 2016 | 16h00

Meu caríssimo Waldemiro Pinto,

Espero que receba esta mensagem. Esteja onde estiver. Da última vez, me informaram lá no cemitério de Pinheiral, um pouquinho abaixo de Volta Redonda, que não sabem direito em qual túmulo você está descansando desde 27 de fevereiro de 2013. Você foi enterrado como indigente, depois de trazer a medalha de ouro dos Jogos Pan-americanos de Chicago, em 1959, e de ter lutado na Olimpíada de Roma, em 1960, sempre como peso-galo.

Achei que você ficaria feliz de saber como andam as coisas para os Jogos Olímpicos do Rio de Janeiro, cidade onde você fez grandes lutas antes de viajar para uma aventura de quase 40 anos no Equador – onde foi lutador de boxe, massagista de futebol, lanterninha de cinema e nos últimos tempos andarilho pelas ruas de Quito, antes de ser resgatado pela equipe de reportagem da ESPN Brasil e voltar ao seu país, em junho de 2000.

Como no seu tempo, os atletas olímpicos do Brasil não tiveram muito carinho da cartolagem para estes Jogos em nossa terra. A verdade é que a Olimpíada é um grande negócio que se realiza de quatro em quatro anos: em alguns países adiantados, os atletas também lucram. Em outros só os empresários, empreiteiros e dirigentes é que lucram.

Se é que você me entende.

A Olimpíada é um grande negócio!

Nenhum dos responsáveis pela Olimpíada esteve preocupado com o desenvolvimento do esporte brasileiro. Se fosse assim, não teriam concretado a pista de atletismo do Estádio Célio de Barros, onde os atletas cariocas treinavam. Nos últimos tempos até “raves” foram realizadas lá, e não se sabe em benefício de quem foi a bilheteria.

E o campo de golfe construído em área de proteção ambiental?

No seu tempo de lutador, a Lagoa Rodrigo de Freitas já era tão poluída? Há uma informação de que a poluição é noticiada sempre que querem esconder um outro assunto bombástico. É... o tal departamento de marketing e factoides do Comitê Olímpico Internacional. Tudo muito elegante, moderno, virtual.

E o caso do laboratório brasileiro do antidoping descredenciado pela WADA – a associação que cuida do doping no mundo?

O doutor Francisco Radler, um cientista digno da Universidade Federal do Rio de Janeiro, deve estar irado com a situação.

Vai ser difícil entender o que aconteceu de verdade.

O handebol teve a construção de uma arena que depois será desmontada, enquanto a Federação Carioca funciona no porta-malas do carro da presidente.

E a ginástica, meu caro Galo Preto – era assim que te chamavam quando disputou o título sul-americano, não é?

Bem, a ginástica faz suas reuniões da federação carioca no estacionamento de um shopping, porque não tem sede.

E a federação de basquete ocupa uma saleta da Confederação da modalidade. O campeonato feminino de basquete tem só três times e as meninas nunca entraram no ginásio de basquete do Pan. O tal legado de 2007 custa muito caro para abrir suas portas.

Ah, Waldemiro, lembra quando você voltou ao Brasil e encontrou seu filho em Volta Redonda? Lembra que numa entrevista na ESPN Brasil, o presidente Carlos Arthur Nuzman declarou que um brasileiro como você, com sua história, com sua medalha de ouro pan-americana e sua participação olímpica seria recebido com honras de grande campeão?

Pois é, eu sei que ele nunca te chamou lá em Volta Redonda. Nem deve saber que você passou os últimos tempos no “Recanto dos Velhinhos Francisco Gonçalves Barbosa”, em Pinheiral, contando histórias de boxe para a Cidinha, cuidadora que é o xodó do asilo.

O COB também não te deu uma réplica da medalha, que você perdeu em seu bailado difícil pelo mundo dos ringues.

O que? Se eu acho que iam te convidar para carregar a tocha, se você estivesse aqui no mundo? Acho que não, tem mais grã-fino carregando a tocha do que atletas... Alguns até têm de pagar, para ficar com a lembrança.

Uma coisa eu sei: se morasse na Vila Autódromo, você seria desalojado, com medalha de ouro e tudo. Você e todos os moradores, junto com a dona Penha, mulher de 48 quilos e toneladas de dignidade. Enfrentou até o Batalhão de Choque para defender a moradia de gente que tinha concessão do governo estadual para residir no local.

Mais um detalhezinho, meu caro: o seu nome está escrito errado no livro editado pelo Comitê Olímpico Brasileiro. Na página 191, que fala da delegação nacional que foi aos Jogos de Roma, está escrito: peso-galo Waldomiro Pinto. Bobagem, Waldemiro.

É, mas só para você saber: o Nuzman continua como presidente do Comitê Olímpico. Sim. E disse que após a olimpíada do Rio pretende continuar como presidente do COB. Talvez mais dois mandatos, viu, Waldemiro?

É, ele mesmo que, quando assumiu o comando do COB, prometeu transformar o Brasil em uma potência olímpica em 8 anos. Verdade. Não cumpriu, mas por que não continuar tentando?

Tivemos o legado do Pan não é?

Você sabe da história do velódromo construído para os Jogos de 2007, não sabe? Você estava vivo ainda. Fizeram o velódromo, que custou R$ 18 milhões. E para ser adaptado para a Olimpíada ele precisaria de alguns ajustes, que custariam mais R$ 14 milhões segundo o arquiteto holandês Sander Douma – a maior autoridade do mundo em ciclismo de pista.

Mas o que resolveram os nossos diletos dirigentes, Waldemiro?

Ora, vamos derrubar esta obra e fazer outra!

O próprio Sander achou uma loucura: “Só no Brasil mesmo, vocês são loucos”.

Loucos ou não, o novo velódromo foi erguido pela bagatela de R$ 147 milhões. O dinheiro sobra, não é?

Além do mais a obra atrasou e não deu tempo de fazer um evento teste no local.

Como Waldemiro, você não entendeu?

Nem nós. Mas a história das bicicletas é muito pior.

Como o assunto do velódromo vazou, os dirigentes resolveram doar a carcaça do “legado” desmontado para alguma cidade. Um presente. Uma “bicicleta de grego”, digamos.

E tudo foi parar em Pinhais, no Paraná.

Transferir o material custou só R$ 1 milhão ou 2. O transporte foi feito em oito carretas. O material elétrico ficou em um galpão com um aluguel de... somente R$ 10 mil mensais – já houve alguns roubos de fio, mas coisa pequena.

A ferragem está no terreno, a céu aberto, onde um dia o velódromo será remontado. E aparentemente está enferrujando. A nova pista de madeira importada virá de algum lugar. A anterior, de pinho de riga, foi totalmente inutilizada, pois foi presa ao piso com 180 mil pregos na época do Pan.

Diz a lenda que a pilha de madeira virou lenha em alguma pizzaria.

Não, não tenho certeza disso, Waldemiro.

O que eu sei é que com tudo isso, a Olimpíada do Rio vai ser a maior festa esportiva de todos os tempos – muito diferente da fraca participação popular de Atlanta, por exemplo, sem falar do atentado e das ameaças. Pode conferir isso de onde você estiver. Nosso povo é animado, adora esportes, o cenário natural do Rio é fantástico, e o nosso clima é encantador – e você sabe disso desde os tempos em que lutava nas noites de boxe da TV Rio, com apresentação do Léo Batista.

A violência urbana?

Ah, Waldemiro, isso é tudo controlável.

Acerto de chefes para que nada aconteça durante as os grandes eventos cariocas: lembra da Eco-92, da visita do Papa, do campeonato mundial de futebol?

Depois, tudo volta ao normal, claro.

Ops! Waldemiro, brilha uma luz fraquinha no final dos túneis abertos para a remodelação urbana. Parece... parece, Waldemiro, que uma incrível série de denúncias virá a público após os Jogos Olímpicos.

Denúncias que só não explodiram ainda porque seriam catastróficas para a realização da competição.

É... dizem que não vai sobrar pedra sobre pedra no mundo da cartolagem.

Sim!!! Algo como aquilo que sacudiu a CBF.

Tá bom, você tem razão, o prédio da CBF continua em pé.

Está certo, Waldemiro, talvez eu esteja sendo otimista demais.

Claro, vamos torcer pelos meninos do boxe, representantes legítimos do povo brasileiro nos ringues olímpicos.

Lembranças para quem? Para o nosso representante no salto triplo?

Rapaz!!! Acredite, não teremos ninguém nesta prova no masculino. Ninguém se classificou.

Eu sei, é a prova do Adhemar Ferreira da Silva, do Nélson Prudêncio, do João do Pulo...

Paciência, Waldemiro. Paciência.

Outras medalhas virão!

Opa...Tá caindo a rede, Waldemiro Pinto. Mas acho que deu para você entender o que está acontecendo com o esporte nacional.

Tá picotando... Um abraço! E se eu achar sua medalha de ouro, ganha em Chicago, levo sim para o Cemitério de Pinheiral. Você só precisa avisar seu endereço certinho.

ROBERTO SALIM, JORNALISTA, IDEALIZADOR DO PROGRAMA ‘HISTÓRIAS DO ESPORTE’, DA ESPN BRASIL, COBRIU SEIS JOGOS OLÍMPICOS, SETE COPAS DO MUNDO E DOIS PAN-AMERICANOS